【香赞】

炉香乍爇，法界蒙熏，诸佛海会悉遥闻，

随处结祥云，诚意方殷，诸佛现全身。

南无香云盖菩萨摩诃萨(合掌三称)

南无本师释迦牟尼佛(合掌三称)

【净身业真言】

唵修哆唎修哆唎修摩唎修摩唎萨婆诃(三遍)

【净口业真言】

唵修利修利摩诃修利修修利萨婆诃(三遍)

【净意业真言】

唵嚩(wā)日(zhi)囉(là)怛诃贺斛(hú)(三遍)

【净三业真言】

唵娑嚩婆嚩秫驮娑嚩达摩娑嚩婆嚩秫度憾(三遍)

【安土地真言】

南无三满多母驮喃唵度噜度噜地尾娑婆诃(三遍)

【普供养真言】

唵誐(ye)誐曩(nǎng)三婆嚩(wā)韈(wà)日(zhi)啰(là)斛(hú) (三遍)

【发愿文】

稽首三界尊，皈命十方佛。

我今发宏愿，持此药师经。

上报四重恩，下济三涂苦。

若有见闻者，悉发菩提心。

尽此一报身，同生琉璃国。

亲觐大慈父，殷勤闻真谛。

学习狮子吼，回返娑婆地。

度众脱苦海，弘法利群迷。

【奉请十二药叉大将】

奉请：宫毗罗大将。奉请：伐折罗大将。

奉请：迷企罗大将。奉请：安底罗大将。

奉请：额你罗大将。奉请：珊底罗大将。

奉请：因达罗大将。奉请：波夷罗大将。

奉请：摩虎罗大将，奉请：真达罗大将。

奉请：招杜罗大将。奉请：毗羯罗大将。

【奉请八菩萨】

奉请：文殊师利菩萨。

奉请：观世音菩萨。

奉请：得大势菩萨。

奉请：无尽意菩萨。

奉请：宝檀华菩萨。

奉请：药王菩萨。

奉请：药上菩萨。

奉请：弥勒菩萨。

【药师赞】

十二大愿，饶益有情，密咒加持德难名，

礼念愿圆成，怨业冰清，寿永福慧宏。

南无药师琉璃光如来(合掌三称)

南无药师会上佛菩萨(合掌三称)

【开经偈】

无上甚深微妙法，百千万劫难遭遇，

我今见闻得受持，愿解如来真实义。

【药师琉璃光如来本愿功德经】

·结诵仪

【补阙真言】

南谟喝啰怛那，哆啰夜耶。佉啰佉啰。俱住俱住。摩啰摩啰。虎啰，吽。贺贺，苏怛拏，吽。泼抹拏，娑婆诃。(三遍)

【药师赞】

药师佛延寿王，光临水月坛场。

悲心救苦降吉祥，免难消灾障。

忏悔众等三世罪，愿祈福寿绵长。

吉星高照沐恩光，如意保安康。

吉星高照沐恩光，如意保安康。

【药师偈】

药师如来琉璃光，焰网庄严无等伦，

无边行愿利有情，各遂所求皆不退。

南无东方净琉璃世界消灾延寿药师佛(合掌数称)

南无消灾延寿药师佛(合掌三称)

南无日光遍照菩萨(合掌三称)

南无月光遍照菩萨(合掌三称)

【药师灌顶真言】

那谟薄伽筏帝鞞杀社窭噜薛琉璃钵喇婆喝囉阇也怛他揭多耶阿囉诃帝三藐三勃陀耶怛侄他唵鞞杀逝鞞杀逝鞞杀社三没揭帝莎诃(七遍)

【药师心咒】

喋(dié)雅(yǎ)他(tā)嗡(wēng)贝堪(kān)则贝堪则

玛哈贝堪则喇杂萨(sà)目 嘎(gā)喋(dié)梭哈(七遍)

【解冤咒】

解结解结解冤结，解了多生冤和业，

洗心涤虑发虔诚，今对佛前求解结。

药师佛，药师佛，消灾延寿药师佛，

随心满愿药师佛。(三遍)

【消解病咒】

唵致哩哆致哩哆晖(yun)咤唎 娑婆诃(三遍)

【赞】

十二药叉大将。助佛宣扬。五色彩缕结其名。

随愿悉圆成。冤业冰清。福寿永康宁。

药师教主。延寿能仁。日光普照月光临。

菩萨降福隆。药叉神明。拥护保安宁。

药师会上。炽盛光王。十二大愿妙难量。

苦海作舟航。广大吉祥。诸佛尽称扬。

药师会上。琉璃光王。八大菩萨降吉祥。

七佛护坛场。日月威光灭罪免灾殃。药师大愿。

功德无边。大千沙界尽包含。宝地布金莲。我佛宏宣。福寿广增延。

【回向文】

愿消三障诸烦恼,愿得智慧真明了,

普愿罪障悉消除,世世常行菩萨道。

佛光注照○○○(称自己名或他人名)本命元辰，灾星退度福星临，九耀保长生。运限和平，福寿永康宁。

愿以此功德，供养药师佛，上报四重恩，下济六道苦。

法界诸众生，悉发菩提心，尽此一报身，同生琉璃国。

以上就是诵读药师经的仪轨了，其实我们诵读药师经的好处很多，但前提是我们修行药师经的时候要诚心，这样我们就能够知道经文讲述的道理，让我们从中得到感悟的。以上只是作者对文章的一些理解，如果有不正确的地方还望海涵。